Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms