Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ccdc6D3YZP9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ccdc6D3YZP9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc6D3YZP9 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms