Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf217D3YYI7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms