Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cttnbp2B9EJA2 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms