Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtprbB2RU80 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms