Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Samt1A2BED8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Samt1A2BED8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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