Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Lcn6A2AJB9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Lcn6A2AJB9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Lcn6A2AJB9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms