Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Hdac6Q9Z2V5 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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