Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms