Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skp2Q9Z0Z3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms