Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Pfdn5Q9WU28 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Pfdn5Q9WU28 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Pfdn5Q9WU28 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Pfdn5Q9WU28 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Pfdn5Q9WU28 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Pfdn5Q9WU28 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Pfdn5Q9WU28 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Pfdn5Q9WU28 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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