Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf4Q9QZS2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms