Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a3Q9QZS0 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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