Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Sfmbt1Q9JMD1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Sfmbt1Q9JMD1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sfmbt1Q9JMD1 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms