Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Rabgef1Q9JM13 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rabgef1Q9JM13 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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