Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Tmod4Q9JLH8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Tmod4Q9JLH8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Tmod4Q9JLH8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Tmod4Q9JLH8 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmod4Q9JLH8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Tmod4Q9JLH8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Tmod4Q9JLH8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Tmod4Q9JLH8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Tmod4Q9JLH8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Tmod4Q9JLH8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Tmod4Q9JLH8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Tmod4Q9JLH8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Tmod4Q9JLH8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Tmod4Q9JLH8 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Tmod4Q9JLH8 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms