Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nectin3Q9JLB9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms