Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gde1Q9JL56 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms