Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM5

Yipf7, Protein YIPF7, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf7Q9JIM5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Yipf7Q9JIM5 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms