Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Ccl28Q9JIL2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Ccl28Q9JIL2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl28Q9JIL2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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