Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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Rb1cc1Q9ESK9 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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Rb1cc1Q9ESK9 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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Rb1cc1Q9ESK9 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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Rb1cc1Q9ESK9 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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Rb1cc1Q9ESK9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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Rb1cc1Q9ESK9 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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Rb1cc1Q9ESK9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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Rb1cc1Q9ESK9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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Rb1cc1Q9ESK9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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Rb1cc1Q9ESK9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms