Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm2541-201ENSMUST00000161209 711 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Tmigd1-201ENSMUST00000072633 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ms4a4bQ9ES61 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4bQ9ES61 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4bQ9ES61 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4bQ9ES61 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4bQ9ES61 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4bQ9ES61 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4bQ9ES61 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4bQ9ES61 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4bQ9ES61 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4bQ9ES61 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4bQ9ES61 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4bQ9ES61 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4bQ9ES61 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4bQ9ES61 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4bQ9ES61 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4bQ9ES61 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4bQ9ES61 Gm11817-201ENSMUST00000155578 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ms4a4bQ9ES61 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms