Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim54Q9ERP3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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