Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms