Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim23Q9DAL0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms