Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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