Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms