Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms