Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cldn23Q9D7D7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Cldn23Q9D7D7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Cldn23Q9D7D7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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