Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Nop56Q9D6Z1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Nop56Q9D6Z1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Nop56Q9D6Z1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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