Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Syce1Q9D495 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Syce1Q9D495 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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