Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms