Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef12Q9D2F1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms