Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms