Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtf2e1Q9D0D5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms