Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snf8Q9CZ28 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snf8Q9CZ28 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snf8Q9CZ28 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snf8Q9CZ28 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snf8Q9CZ28 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snf8Q9CZ28 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snf8Q9CZ28 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snf8Q9CZ28 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snf8Q9CZ28 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snf8Q9CZ28 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snf8Q9CZ28 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snf8Q9CZ28 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snf8Q9CZ28 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snf8Q9CZ28 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snf8Q9CZ28 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms