Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mis12Q9CY25 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mis12Q9CY25 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms