Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Utp23Q9CX11 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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