Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms