Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWB5

Pgpep1l, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1lQ9CWB5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Pgpep1lQ9CWB5 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Pgpep1lQ9CWB5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Pgpep1lQ9CWB5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Pgpep1lQ9CWB5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Pgpep1lQ9CWB5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Pgpep1lQ9CWB5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Pgpep1lQ9CWB5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Pgpep1lQ9CWB5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms