Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Lhfpl3Q9CTN8 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms