Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms