Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Higd2aQ9CQJ1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Higd2aQ9CQJ1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms