Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RTRAFQ9CQE8 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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