Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Chmp3Q9CQ10 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Chmp3Q9CQ10 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Chmp3Q9CQ10 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Chmp3Q9CQ10 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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