Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Commd4Q9CQ02 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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