Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg3Q9CPX6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg3Q9CPX6 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms