Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms