Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
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