Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms